全自动核酸提取仪可广泛应用于基因组学、疾控医疗、食品安全、法医鉴定、输血安全、畜牧业与分子学研究等领域，比如鼻咽拭子、唾液、全血、血清、环境样本、分泌物、粪便、动物组织、植物组织、细菌、真菌、病毒、质粒等各种样本的核酸提取，结果稳定。
1.洗涤步骤：
洗涤对于整个提取步骤至关重要，关系到核酸的纯度，核酸的纯度直接影响下游 PCR应用。磁棒的振荡幅度和混合时间会影响洗涤效率。磁棒振荡幅度太小或混合时间太短，有杂质残留在磁珠上会影响磁珠吸附核酸的能力。振荡太剧烈或时间太长，会丢失部分核酸或造成核酸的断裂、降解，得率下降。
2.裂解步骤：
样本裂解是核酸提取过程中很关键的一步，只有充分裂解了细胞或病原体，才能释放里面的核酸。
磁珠结合效率决定了有多少核酸可以吸附到磁珠上，即洗脱核酸的上限。影响结合效率的因素有磁珠的吸附能力以及结合缓冲液的结合能力。
3.洗脱步骤：
洗脱步骤直接影响核酸得率，影响洗脱效率的因素有磁珠的干燥程度以及洗脱温度和时间。磁珠未充分晾干，可能会有醇类等杂质残留，影响后续 PCR 反应；磁珠过分干燥，核酸可能会干结在磁珠上，导致洗脱效率下降。适当提高洗脱温度和时间，有利于核酸从磁珠上游离下来，时间过长或温度过高，核酸有可能会降解，需要把握其中的平衡。
